Raphael wurde im März 1997 von Gitarrist und Bandleader Kazuki und Bassist Yukito gegründet. Kurze Zeit später stiessen Sänger Yuki und schliesslich Schlagzeuger Hiro dazu. Allen Mitgliedern gemeinsam war ihre Jugend, denn sie waren zur Zeit der Bandgründung erst 15 Jahre alt!
Ihren ersten Liveauftritt hatte die junge Formation Ende 1997. In diesem Jahr veröffentlichte sie auch ihr erstes und einziges Demo-Tape, "Eternal Wish".
1998 brachten sie ihr erstes Mini-Album, "LILAC", sowie die Single "White Love Story" heraus, die trotz des zartes Alters der Musiker erstaunlich ausgereift klangen.
1999 war ein sehr erfolgreiches Jahr für das Quartett. Im Frühjahr veröffentlichte es zwei Singles und eine Maxi-Single und Mitte des Jahres unterzeichnete es einen Plattenvertrag mit dem Major-Label FOR LIFE MUSIC ENTERTAINMENT. Die erste Single auf dem neuen Label, "Hana Saku Inochi Aru Kagiri", erschein im Juli, gefolgt von zwei weiteren Singles, sowie dem Mini-Album "Mind Soap".
Wie viele Visual Kei Bands legten auch Raphael mit ihrem Indie-Status ihr auffälliges Äusseres zugunsten eines "natürlicheren“ Looks ab. Aufwendige Kostüme und dickes Makeup wichen schlichten hellen Anzügen, doch ihre Musik blieb von diesem Wandel unberührt und Raphael selbst erklärten, sie hätten sich nicht verändert.
Auch im folgenden Jahr waren sie sehr produktiv und veröffentlichten zwei Singles, zwei Mini-Alben und zwei Videos. Die Single "Lost Graduation", das Mini-Album "Sotsugyô" und das Video "Raphael Special LIVE 'graduation' -2000.3.4 Nippon Budokan-" waren alle der Tatsache gewidmet, dass die Mitglieder von Raphael in diesem Jahr ihren Highschool-Abschluss gemacht hätten, wenn sie nicht Musiker geworden wären, sondern weiterhin die Schulbank gedrückt hätten.
Nach drei sehr erfolgreichen Jahren verliess sie jedoch das Glück. Am 31. Oktober 2000 wurde Bandleader und Songwriter Kazuki mit einer Überdosis Beruhigungsmittel tot aufgefunden. Es scheint sich dabei um einen Unfall gehandelt zu haben, denn er hatte noch kurz zuvor in einem Interview von seinem grossen Tatendrang gesprochen. Er wurde nur 19 Jahre alt.
Die zurückgebliebenen Bandmitglieder brachten im folgenden Jahr noch einige Releases heraus, darunter das Mini-Album "Fumetsuka" und die DVD "forever and ever", die dem Andenken von Kazuki gewidmet waren, eine Singles-Kollektion, sowie eine Kollektion ihrer Video-Clips und zwei Live-DVDs. Sie hatten jedoch schon vor Kazukis Tod beschlossen, zu pausieren, um danach neu gestärkt zurückzukehren, und nun setzten sie diesen Entschluss in die Tat um.
Schliesslich kam es jedoch zur endgültigen Trennung. Hiro und Yuki gründeten die Band Rice und Yukito sein Solo-Projekt Black Love, das sich jedoch ebenfalls trennte.
Im Jahr 2012 kündigten sie jedoch überraschend an, dass Raphael zwei Revivalkonzerte spielen würde. Das erste der beiden Konzerte fand am 31. Oktober statt, dem Datum, an dem Kazuki vor zwölf Jahren verstorben war, und zeigte, dass sein Tod die Bandmitglieder noch immer tief bewegte. Am selben Tag veröffentlichten sie ausserdem eine Neuaufnahme ihrer Single "eternal wish ~todokanu kimi e~" aus dem Jahr 1999. Die neue Version, die unter dem Namen Raphael -Starring Kazuki- erschien, enthielt auch drei unveröffentlichte Songs: "Dear", "Haikei Nervous" und "Elf no yuutsu". Das zweite Konzert fand am folgenden Tag, dem 1. November statt, und beide Shows waren in Rekordzeit ausverkauft. Die Konzerte wurden für die Nachwelt aufgenommen und so veröffentlichte die Band im Dezember das Livealbum "Tenshi no hinoki butai" und die Live-DVD "Tenshi no hinoki butai dai ichi ya "Hakuchumu"". Im Januar folgte eine weitere Live-DVD, "Tenshi no hinoki butai dai ni ya "Kokuchumu"", die zusätzliches Material von den Revivalkonzerten enthielt.
Obwohl das Revival sich als sehr erfolgreich erwies, wurden keine weiteren Aktivitäten angekündigt, und derzeit ist unklar, ob Raphael ihre Karriere wieder aufnehmen werden.
